ジムニー／ジムニーシエラのマニュアルトランスミッションは、先代と同じく5速MTだ。MTをラインアップしているだけで、国産車としてはレアケースだという言い方もできるが、なにせ、モデルがジムニーである。MTは必須と言えるのだ。
では、先代と新型のギヤ比を見てみよう。
■先代（JB23型）ジムニー
5速MT
1速：5.106
2速：3.017
3速：1.908
4速：1.264
5速：1.000
後退：5.151
トランスファー
高速変速比：1.320
低速変速比：2.643
最終減速比：4.300
■先代ジムニーシエラ
5MT
1速：4.425
2速：2.304
3速：1.674
4速：1.190
5速：1.000
後退：5.151
トランスファー
高速変速比：1.320
低速変速比：2.643
最終減速比：3.416
では、新型はどうだろう？
■現行ジムニー
5速MT
1速：5.809
2速：3.433
3速：2.171
4速：1.354
5速：1.000
後退：5.861
トランスファー
高速変速比：1.320
低速変速比：2.643
最終減速比：3.818
■現行ジムニーシエラ
5速MT
1速：4.425
2速：2.304
3速：1.674
4速：1.190
5速：1.000
後退：5.151
トランスファー
高速変速比：1.000
低速変速比：2.002
最終減速比：4.090
ジムニーは、新型でギヤ比が変わっているが、ジムニーシエラは同じギヤ比だ。
マニュアル・トランスミッションは、オートマチック・トランスミッションと違って、自動車メーカーが自製するケースが多い。ギヤ比の変更も比較的容易だ。現行ジムニー／ジムニーシエラの開発にあたって、スズキが新規にMTを設計・製造するのは、さして不思議ではない。
ジムニーのマニュアル・トランスミッションで特徴的なのは、オーバードライブがない、といことだ。ギヤ比を見てみよう。最高速段の5速のギヤ比は、1.000。つまり直結だ。たとえば、同じスズキのアルトワークスの5MT（エンジン横置きのFF）の5速MTのギヤ比は、1速：3.545、2速：2.105、3速：1.521、4速：1.148、5速：0.897となっていて、5速はオーバードライブである。つまり、新型ジムニー／ジムニーシエラも高速走行は、あまり重要視していない、ということなのだろう。
とはいえ、トランスファー（副変速機）が新スペックとなっているジムニーシエラの場合、5速走行時のギヤを見てみると、1.000×1.000×4.090でトータル4.090となる。
先代ジムニーシエラでは1.000×1.320×3.416でトータル4.509となる。これがエンジンが1.3ℓから1.5ℓになった恩恵と言えるだろう。タイヤサイズも考えなければならないが、高速走行時のエンジン回転数は新型では少し下がるだろう。
ちなみに、現行ジムニーのトランスファーは、先代と同じ、アイシン・エーアイ製のTJ2を使っている。